在第三季里，是神奇仙子开始在艾菲城学院的第三学期，神奇仙子得在自己的家乡，靠着自己的力量为某人做出牺牲，得到了独特的变身能力，并成为超仙灵女（Enchantix），也就是真正的仙子。而也有新的成员-那布(Nabu)，和新的敌人-魔陀…

人类女孩Rose无意中进入了魔法世界，在这里她结识一众著名的童话人物以及公主们的后代，并且要慢慢地解开自己的身世之谜。

天上的所有星星都神秘地一个接一个地消失，逐渐将魔幻宇宙的各个世界抛入黑暗。看来，魔陀的返回隐瞒了这一可怕的威胁，而魔陀据说是蕾儿用她的魔法仙尘扑灭了龙火精华而击败的。欧菲亚的小精灵将前往索太阳仙界的恒星罗曼尼亚，窦若娜女…

魔法仙子现在回到了地球，并受到了人们的热烈欢迎与爱戴。在安卓斯海洋世界，那普顿王正要册封他的孩子泥利斯成为下一个掌管海洋皇帝，但仪式进行到一半的时候，被一直想要争夺王位的天那斯——泥利斯的哥哥搞砸了。天那斯企图阻止这场登…

法拉刚达展示了仙女们的欧菲雅自然公园，这里有来自世界各地的最稀有的神奇动物。在这个新系列中，我们将发现动物真正的重要性，揭示出魔法本身的主要力量与动物有关，这是一种特殊生物的小型万神殿。每个神奇动物，从最小的到最大的，都…

在浩瀚無邊的宇宙某處，女巫和精靈正進行正邪不兩立的對峙戰鬥。在這稱做“仙界”的奇幻世界中，精靈、人類和女巫們都必須為生存而戰。形形色色的精靈和女巫，個個都能展現和本身個性相關的超能力。蕾兒和四個好友所組成的“仙靈組”，誓…

神奇仙子接受法拉刚达的聘书，以魔法老师的身分回到艾菲城学院。不久四位神秘的巫师闯进艾菲城学院发动攻击，以压倒性优势击败神奇仙子。当他们抓住蕾儿的时候发现蕾儿不是他们的目标，便丢下蕾儿离开。法拉刚达这才告诉神奇仙子那些巫师…

某日，仙子莱拉从达卡魔王手中逃脱，昏迷在树林边被蕾儿的神奇仙子所救，之后加入神奇仙子并跟着就读艾菲城学院。而三妖后被安置在光圣修道院进行感化教育。达卡魔王入侵光圣修道院带走三妖后并收编，命她们为自己寻找秘笈，好解放自己的…